본 발명은 채널 구조의 유기박막 태양전지 제조방법에 관한 것으로, 유기박막 태양전지 제조방법에 있어서, 준비된 기판 표면으로 서로 수평한 벽면(wall 110)이 나란히 형성되도록 패턴화하여 기판을 제조하는 단계, 상기 기판 벽면이 형성된 표면으로 하부전극(애노드 200) 패턴을 형성하는 단계, 상기 전극 패턴 표면으로 버퍼층(300)을 형성하는 단계, 상기 버퍼층 표면으로 활성층(유기광전층 400)을 형성하는 단계, 상기 활성층 표면으로 전자수용층(500)을 형성하는 단계 및 상기 전자수용층 표면으로 상부전극(캐소드 600) 패턴을 형성하는 단계를 포함하여 구성되는 것을 특징으로 한다.